Los Programas del IAA están regidos por el Artículo 8º de su Reglamento, según el cual, “los Programas de Investigación son planes de trabajo correspondientes a campos temáticos de carácter permanente, con objetivos parciales a desarrollar en etapas no menores de dos (2) años ni mayores de cuatro (4) años y a cargo de un equipo de investigadores conducido por un Director de Programa con rango de Profesor Titular, Asociado o Adjunto, o de méritos equivalentes, debiendo tener aprobación del Director del IAA. Los Programas de Investigación pueden constituirse por estar propuestos en las orientaciones generales de trabajo del IAA; o bien por fusión de dos (2) o más Proyectos de Investigación en torno a objetivos comunes, en la medida que se justifique por la extensión y complejidad de dichos objetivos, así como por la disponibilidad de los recursos necesarios.”
En la actualidad, los programas que se desarrollan en el IAA son:
- Tiempos Americanos
- Programa Diseños de Estado
- Programa de Patrimonio Cultural
- Historia Urbana y Territorial
- Arquitectura y Construcción con Tierra (ARCONTI)
- Viajeros y ciudades
